技術(shù)名稱 Sequenom MassARRAY SNP基因型分析技術(shù)
技術(shù)原理 MassARRAY時(shí)間飛行質(zhì)譜生物芯片系統(tǒng)由專業(yè)生產(chǎn)生物芯片系統(tǒng)用于遺傳突變及SNP領(lǐng)域研究的美國(guó)Sequenom公司開發(fā)交流研討,是目前唯一采用質(zhì)譜法直接檢測(cè)SNP的設(shè)備擴大。MassARRAY系統(tǒng)已用作在不同人種中尋找的異性的SNP生產體系,稱之為Hapmap計(jì)劃作用。該系統(tǒng)的突出特點(diǎn)是能以極高的精確度快速進(jìn)行基因型識(shí)別,直接測(cè)出帶有SNP或其他突變的目標(biāo)DNA重要組成部分。MassARRAY系統(tǒng)反應(yīng)體系為非雜交依賴性探討,不存在潛在的雜交錯(cuò)配干擾,不需要各種標(biāo)記物培養,其采用的高密度SpectroCHIP點(diǎn)陣芯片分析系統(tǒng)能在4小時(shí)之內(nèi)完成多達(dá)3840個(gè)多重性鑒定,每個(gè)檢測(cè)點(diǎn)只需3-5秒趨勢,全自動(dòng)分析高效流通。這套系統(tǒng)及時(shí)提供了大規(guī)模、高能量檢測(cè)SNP的技術(shù)平臺(tái),順應(yīng)了當(dāng)前醫(yī)學(xué)疾病基因組疾病機(jī)制研究迅猛發(fā)展的趨勢(shì)有力扭轉。 Sequenom SNP檢測(cè)系統(tǒng)基本原理為基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS)技術(shù)調解製度。主要特點(diǎn)是,PCR擴(kuò)增后的產(chǎn)物形式,加入SNP序列特異延伸引物覆蓋範圍,在SNP位點(diǎn)上,延伸1個(gè)堿基進行培訓。然后將制備的樣品分析物與芯片基質(zhì)共結(jié)晶科普活動,將該晶體放入質(zhì)譜儀的真空管,而后用瞬時(shí)納秒(10-9s)強(qiáng)激光激發(fā)關鍵技術,由于基質(zhì)分子經(jīng)輻射所吸收的能量逐漸完善,導(dǎo)致能量蓄積并迅速產(chǎn)熱,從而使基質(zhì)晶體升華有所提升,核酸分子就會(huì)解吸附并轉(zhuǎn)變?yōu)閬喎(wěn)態(tài)離子了解情況,產(chǎn)生的離子多為單電荷離子,這些單電荷離子在加速電場(chǎng)中獲得相同的動(dòng)能法治力量,進(jìn)而在一非電場(chǎng)漂移區(qū)內(nèi)按照其質(zhì)荷比率加以分離長期間,在真空小管中飛行到達(dá)檢測(cè)器。MALDI產(chǎn)生的離子常用飛行時(shí)間(Time-of-Flight, TOF)檢測(cè)器來(lái)檢測(cè)技術研究,離子質(zhì)量越小是目前主流,就越快到達(dá)。理論上講的積極性,只要飛行管的長(zhǎng)度足夠更多可能性,TOF檢測(cè)器可檢測(cè)分子的質(zhì)量數(shù)是沒(méi)有上限的。MASSARRAY SNP檢測(cè)的質(zhì)譜范圍為5000到8500 Dalton高效。
技術(shù)特點(diǎn) 靈活: 可以自由選擇感興趣的SNP位點(diǎn) 一張芯片上分析,樣本的數(shù)量和位置可以自由選擇 一張芯片上,樣本和SNP位點(diǎn)的配對(duì)可以自由選擇 準(zhǔn)確: 直接檢測(cè)待測(cè)物分子量質量,準(zhǔn)確度超過(guò)99.7% 質(zhì)譜技術(shù)靈活檢測(cè)PCR實(shí)驗(yàn)失敗或三等位基因的存在 高通量: 一張芯片上可完成384個(gè)樣品的多重iPLEX GOLD實(shí)驗(yàn) 每個(gè)反應(yīng)孔可實(shí)現(xiàn)多達(dá)40重反應(yīng) 每天最多能進(jìn)行十萬(wàn)個(gè)基因型分析 性價(jià)比高: 無(wú)需熒光標(biāo)記,成本大大降低 即便在低通量的情況下每個(gè)基因型分析的成本仍然很低
服務(wù)內(nèi)容 客戶提供基因組DNA或者或者生物樣本,并指定需要檢測(cè)SNP位點(diǎn) 設(shè)計(jì)引物(包括PCR擴(kuò)增引物和單堿基延伸引物) 多重反應(yīng)的設(shè)計(jì) PCR擴(kuò)增不久前、SAP處理緊迫性、單堿基延伸 點(diǎn)樣制備檢測(cè)用芯片陣列 MALDI-TOF質(zhì)譜檢測(cè) 數(shù)據(jù)分析、給出分型報(bào)告
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